Monoklonaler Anti-UAP56/DDX39B-Antikörper für WB, IHC-P, ELISA – Q13838

Zentrale Produktspezifikationen und Parameter

Biologischer Hintergrund: Funktion und Lokalisierung von UAP56/DDX39B

• Die Spleißosom-RNA-Helikase DDX39B, auch bekannt als 56-kDa-U2AF65-assoziiertes Protein, ATP-abhängige RNA-Helikase p47, DEAD-Box-Protein UAP56 und HLA-B-assoziiertes Transkript-1-Protein, wird durch das Gen DDX39B (BAT1, UAP56) kodiert.
• Bestandteil des TREX-Komplexes, der mRNA-Transkription, -Verarbeitung und -Export aus dem Zellkern koppelt. Assoziiert spezifisch mit gespleißter mRNA und wird spleiß- und cap-abhängig in der Nähe des 5′-Endes rekrutiert, wo es am mRNA-Export über den TAP/NXF1-Weg beteiligt ist. Außerdem am Export ungespleißter mRNA aus dem Zellkern beteiligt. Zugehörige Referenzen: PMID:15833825 PMID:15998806 PMID:17190602
• Erforderlich für den ersten ATP-abhängigen Schritt beim Aufbau des Spleißosoms und für die Interaktion des U2-snRNP mit dem Verzweigungspunkt. Zeigt eine RNA-stimulierte ATP-Bindung und -Hydrolyse sowie ATP-abhängige RNA-Entwindungsaktivitäten; die Helikase- und ATPase-Aktivitäten werden durch U2AF2 nicht beeinflusst, obwohl für ALYREF/THOC4 ein stimulierender Effekt beschrieben wurde (PMID:23299939). Zugehörige Referenz: PMID:23299939
• Assoziiert mit SARNP/CIP29, das die RNA-Bindung von DDX39B erleichtert und wahrscheinlich eine Rolle beim mRNA-Export spielt. Zugehörige Referenz: PMID:37578863
• Spielt eine Rolle beim Export intronloser mRNA; der TREX-Komplex ist für den Export intronloser mRNAs des mit dem Kaposi-Sarkom assoziierten Herpesvirus (KSHV) und für die Produktion infektiöser Viren essenziell.
• Die subzelluläre Lokalisierung ist hauptsächlich nukleär, mit Vorkommen in nukleären Speckles; außerdem ist das Protein im Zytoplasma nachweisbar.
• Zu den posttranslationalen Modifikationen gehören Acetylierung, Phosphorylierung und Ubiquitinierung (Bildung von Isopeptidbindungen), wie durch proteomische Identifizierung angezeigt.
• Gehört zur Familie der DEAD-Box-Helikasen; wichtige Motive: ATP-Bindung, Nukleotidbindung und RNA-Bindung. Beteiligt an mRNA-Verarbeitung, mRNA-Spleißen, mRNA-Transport und Genomstabilität.

Experimentelle Hinweise und technische Tipps

• Das Immunogen umfasst die C-terminale Region (Aminosäuren 310–428), die bei Mensch, Maus und Ratte konserviert ist; bei Bedarf sollte die Sequenzhomologie für andere Spezies überprüft werden.
• Für den Western Blot beträgt das vorhergesagte Molekulargewicht 49 kDa; validieren Sie das Ergebnis mit geeigneten positiven und negativen Kontrollen in Ihrem Probensystem.
• Für IHC-P sollten Sie eine Antigenrückgewinnung in Betracht ziehen und die Verdünnung des Primärantikörpers abhängig vom Gewebetyp optimieren; validieren Sie den Antikörper in Geweben, von denen bekannt ist, dass sie UAP56/DDX39B exprimieren.
• Für ELISA sollte rekombinantes Protein als Standard verwendet und die Antikörperkonzentration zur Optimierung des Signal-Rausch-Verhältnisses titriert werden.
• Der Antikörper wird für Forschungszwecke in Studien zur mRNA-Verarbeitung, zum Spleißen und zum nukleären Export empfohlen; die Leistung kann je nach Anwendung variieren.

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